Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdzd9Q9D9M4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms