Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D9H8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D9H8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms