Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TcimQ9D915 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms