Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem41aQ9D8U2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms