Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl4Q9D8E6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms