Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms