Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptp4a3Q9D658 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptp4a3Q9D658 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms