Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rab11fip1Q9D620 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rab11fip1Q9D620 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rab11fip1Q9D620 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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