Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms