Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms