Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms