Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam227bQ9D518 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms