Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms