Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D454 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D454 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D454 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D454 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D454 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D454 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D454 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D454 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D454 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms