Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms