Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms