Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms