Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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