Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms