Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap5-3Q9D226 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap5-3Q9D226 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap5-3Q9D226 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap5-3Q9D226 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap5-3Q9D226 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap5-3Q9D226 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krtap5-3Q9D226 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms