Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd2Q9D1L0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms