Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx17Q9D0I4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx17Q9D0I4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms