Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms