Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gins3Q9CY94 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms