Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms