Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Xrcc2Q9CX47 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Xrcc2Q9CX47 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Xrcc2Q9CX47 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Xrcc2Q9CX47 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc2Q9CX47 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc2Q9CX47 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Xrcc2Q9CX47 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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