Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxxc1Q9CWW7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms