Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Atxn3Q9CVD2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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