Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tma16Q9CR02 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tma16Q9CR02 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tma16Q9CR02 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms