Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Use1Q9CQ56 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Use1Q9CQ56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Use1Q9CQ56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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