Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ubqln4Q99NB8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ubqln4Q99NB8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ubqln4Q99NB8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ubqln4Q99NB8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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