Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kremen1Q99N43 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms