Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsl24d1Q99L28 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms