Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DhddsQ99KU1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DhddsQ99KU1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DhddsQ99KU1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DhddsQ99KU1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DhddsQ99KU1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DhddsQ99KU1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DhddsQ99KU1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DhddsQ99KU1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms