Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpifQ99KR7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpifQ99KR7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms