Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emc3Q99KI3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emc3Q99KI3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms