Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Dok4Q99KE3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dok4Q99KE3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dok4Q99KE3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms