Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms