Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lims1Q99JW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms