Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrif1Q923B3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms