Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim59Q922Y2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms