Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn1Q922Y1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn1Q922Y1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms