Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl3Q91YH5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms