Protein–RNA interactions for Protein: Q91VR8

Brk1, Protein BRICK1, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brk1Q91VR8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Brk1Q91VR8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Brk1Q91VR8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms