Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd1Q8VCZ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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