Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc12Q8R344 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms