Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms