Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms