Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34c1Q8K193 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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