Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scamp1Q8K021 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp1Q8K021 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms